讓顯微影像說自己的故事 台大醫學院 ImageJ 講座

8月13日至8月14日，台灣大學醫學院未來教室舉行兩場座無虛席的顯微影像講座，未能入場的報名者們正期待著教學影片上架。這兩場講座由台大醫學院顯微影像核心實驗室管理人許紹君博士主辦，邀請元利儀器顧問洪金俊博士連日與台大醫學院學生、同仁分享影像處理顯微影像處理利器ImageJ 使用技巧。

ImageJ 是全球生物影像領域最普遍的軟體工具之一，免費、開源、多元工具的特性讓其成為分子生物學研究入門者必修的技能，也是尖端研究者持續善用的工具。洪金俊在第一日的講座分享ImageJ對顯微影像的基本操作，分享如何精確迅速地運用比例尺校正、顆粒計算、3D影像分析等不可或缺的功能。

第二日的講座內容則著重影像飄移校正（drift correction）, 顯微顆粒追蹤（particle tracking）、螢光共位分析（co-localization）、AI深度學習應用等進階影像處理技術。講座教學內容不僅是操作技巧，更釐清各種應用情境的生物學背景、實驗目的、軟體設計相關概念。

例如，在螢光共位分析中，兩種蛋白質的共位與反應（interaction）是經常被直覺性混淆的概念。洪金俊指出，蛋白質共位至少有三種情境，在著眼不同蛋白質的時候，對共位的判定也會改變；不同的共位模式，在分析時也要採用不同的統計檢定。

因此除了影像分析，實驗操作者也要很清楚自己的目標。若反向思考，即使會產生反應的兩種蛋白，也不見得會呈現螢光共位，因此也不必將共位視為決定性的實驗指標。

對於AI深度學習與輔助判斷，洪金俊強調「AI不能幫人分析，而是幫人進行目標判斷與選擇。」ImageJ的AI輔助功能需由使用者進行訓練，因此精準有效的輔助AI，來自使用者提供大量的人工判斷資料。每個使用者訓練出來的AI，判斷同一種細胞或蛋白質的精準度也會稍有不同。洪金俊也基於豐富經驗，分享嚴格判斷目標範圍，以提升AI精準度的技巧。

在台大醫學院顯微影像核心實驗室擔任助研究專家的許紹君說，洪金俊是她在中研院訓練時期的啟蒙者之一。她也表示，ImageJ雖是免費軟體，但其開源的模式讓功能更加全面、不斷更新，台大醫學院的學者也曾貢獻重要的ImageJ功能。希望能透過ImageJ的技術講座幫助院內同學與同仁的實驗更加順利。